بعد إفتتاح متحف سوهاج القومى حدثت بعض المشكلات البيسطة فى التعامل من قبل الزوار للمتحف، وخاص في التعامل مع القطع الأثرية ، والتصوير مع البعض الأخر منها بالإضافة إلى الجلوس على القواعد الخاصة بها الأمر الذى حدا الصفحة الرسمية لمتحف سوهاج بنشر فيديوجراف خاص بقواعد زيارة المتاحف.